澳門教區於1576年1月23日，由教宗額我略十三世頒發《Super Specula Militantis Ecclesiae》詔書批准成立，成為近代遠東第一個主教區。遠東最早成立的主教區，是公元1307年我國元成宗時，在北京成立的總主教區。其次是1313年元仁宗時，在福建成立的泉州教區。兩教區的教務曾蓬勃一時，惜因傳教士後繼無人而停頓。 

 澳門教區成立初期，負責傳教的地區極廣，包括中國、朝鮮、日本、東京（即現今的北越地區），以及遠東大陸鄰近島嶼。 

澳門教區自建立伊始，奉聖女加大肋納瑟納Catarina de Sena和聖方濟各沙勿略Francisco Xavier為主保，以宣示澳門傳教士獨特氣質，就是除了傳播基督福音以外，還致力促進科學交流和推崇道德，以科學與道德”Scientia et Virtus”為教區座右銘。 

澳門教區首位署理主教是耶穌會士賈耐勞Melchior Carneiro S.J.。他創辦本澳的仁慈堂、聖辣法厄爾醫院(俗稱白馬行醫院)、和痳瘋病人收容所(即現在望德堂一帶)。耶穌會士於1565年已在本澳設立會院和開辦學院。到16世紀末，該學院的專上程度獲得歐洲大學承認；他們的聖堂曾兩次毁於火災，1835年大火遺跡，就是現在的大三巴牌坊。 

除耶穌會外，方濟會、奧斯定會、道明會和度隱修生活的聖嘉辣女修會，都曾先後在16、17世紀，於本澳設立了會院。 

澳門教區剛成立時，澳門是許多修會傳教士前往遠東所有傳教區的基地。四百年來，澳門教區轄下各地區教務日漸成長，相繼自立，先後成立了一百個以上的獨立教區。現在，澳門教區的實際範圍，只局限於澳門本埠，共擁有堂區9個堂區，教育機構28間，包括明愛在內不下半百間社會福利服務機構。此外，還有社會傳播、出版事業及牧靈服務等多所機構。在教區內現有聖職人員及修生約70人，修女約130人，教友約3萬人。 

(updated: 31/12/2023)